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All in one算法PowerSomatic8稳定运行半年

克拉斯基因    2018-11-16

All in one算法PowerSomatic8 可以计算肿瘤成对样本SNP、INDEL、CNV、MSI、TMB、MMR等肿瘤标记物。自2018年5月15日发布以来,已经稳定运行6个月,客户反馈很好。计算2017年卫生部肿瘤高通量测序室间质评Illumina部分数据所有项目全部正确,目前PowerSomtic8为业内极少数计算全对的算法。更难得的这算法已经开发成在线计算程序,任何人均可以方便使用,而且使用性价比非常高。一般有生物医学基础的实验人员在短时间内可以掌握,真正做到自己的数据自己分析。

 

PowerSomatic8简介

PowerSomatic8在PowerSomatic6基础上,增加了微卫星不稳定性(MSI)、somatic CNV、药物相关fusion genes计算模块,可以通过自主开发的分析平台直接输出snp、Indel、TMB、MSI检测报告。操作简单灵活方便,输入成对normal/tumor测序数据fastq、fastq.gz,输出注释好的snp、Inde、MSI报表,压缩文件包含vcf格式、矩阵表, 精选数据库注释,并根据变异分布规律,设计变异预期指数,快速准确筛选出肿瘤驱动变异。一般情况下只要Excel即可完成分析。零生物信息学基础都可以快速完成复杂的肿瘤数据分析。有生物医学基础的技术人员一般几天内能掌握分析技能,胜任肿瘤数据分析工作。输出数据也可以用Excel、MATLAB、R语言等工具进行后期科研分析。